如果想学冰魄神针和五毒神掌等，就可以拜李莫愁，但是拜李莫愁需要完成一定解谜剧情，在学全古墓派的武功后，玩家还可以通过解谜拜到杨过门下，杨过乃一代天才小机缘巧合之下，得以学会独孤求败的玄铁重剑，更应小小龙女被困绝情谷底，日思月念，竟自创绝技黯然**掌，古墓派的武功由此具有了缠绵和才猛的双重特性。
黯然**掌虽没有被列位于超级武功之一，但其威力却丝毫不亚于降龙十八掌，玄铁剑法乃独孤求败中年后所创，某些方面的威力甚至比独孤九剑还要强上几分，所以，解谜拜到杨过门下，学会杨过的玄铁歹法和威力强悍的黯然**掌，是所有古墓派弟子的心愿和奋斗目标。
当然，要想学会这两门厉害的武功，据推测，前提是得在同人副本里解谜找到杨过，然后完成某些主线和支线任务才能拜入其门下，虽然时至今日，整个古墓派还没有谁完成了这项解谜，但根据目前整个游戏的进程来看，正在疯狂刷同人副本的古墓派玩家们离他们的目标应该不会太遥远了，至少据忘情阁传来的消息来看，太阳在段紫菱以及白凝等人的帮助下，已经拜到了杨过门下并且学了玄铁剑法，只是因某个解谜环节出了点问题还暂时无法习得黯然**掌。由于古墓派基地的所在十分隐秘，即便是知道其大致地点，没有古墓派弟子带路，常人也很难找到其古墓的入口，所以方杰到了终南止后，决定先易后难，先历练全真教，然后再到后山找古墓派的入口。
终南山一带，基本上只有古墓派和全真教两派弟子在附近活动，两派之间平常虽然也时不时发生一些小矛盾，但两家毕竟是有渊源的，双剑合璧技也需要两派弟子配合施展，所以总的来说，双方还算和睦，终南山一带也就成了两派共同的势力范围，方杰一路往山上行去，所闻所见均是成双成时的古墓派和全真教玩家，这让还是单身的方杰心中忍不住有些羡慕。
全真教基地，便是建筑规模丝毫不亚于少林寺基地的重阳宫，此宫又称重阳万寿宫或祖庵，其规模宏大，殿堂亭台楼阁园林田产房舍俱全，有建筑五千零四十八间，宫内碑石林立，最出名的有赵孟兆页手书重阳祖师图像，七真人图像，万寿宫石刻，圣旨碑等等。
找到重阳真人妾重阳成为全真教客卿后，方杰足足花了半日时间将整个重阳宫地图全部探开，这才进了练功房安心修炼全真教的武功。
全真教的武功体系，有十一大类共十七门武功，不光武功数量多，门类也多，进一步说，武功门类多的门派，都比较中庸，以至于什么都会一点却又无法专精一，二且特点也就显得有此平庸了，与方杰所提倡的，“集，联叩是背道而驰的，这也是玩家们不愿加入全真教的原因之一。
前面说过，全真教的顶级武功为全真剑法和先天功，先天功就不再多说了，只说这全真剑法，绝招有六项，比起其他各派顶级武功的绝招，多了两项，光只看这一点，便能说明全真歹法相较于其他各派顶级武功还是存在着一定优势的。
全真剑法的绝招当中，牵制型绝招为缠字诀，与太极剑法的缠字诀有着异曲同工之妙，乃是恢弘正大的招数，压制对手令其不能轻易出击，如果对方没有深厚的内功根基，将会难于化解。
速度型绝招三连环，其速度极快，可连出三剑，命中率极高，让人难以闪避招架。
定阳针，全真剑法的攻击型绝招，道家的玄门正宗，招式虽然朴实无华，但是非常的有效，是最为扎实之极的剑法招数。倘若对方勘破不了招中奥秘，在遭受到重创的同时更无暇反击，凌厉无比。
一气化三清，全真剑法终极攻击型绝招，攻击力强悍无比，不光出招速度快，而且只出一剑却可化作三剑，分别袭向对手咽喉、丹田、下阴三处要害，具有非凡的攻击力，乃是以气御剑的臻境，但施展此招必须修习深厚的先天功，否则的话，绝招威力难以发挥。
还有一项攻击力强悍且常用的绝招同归剑法，这项绝招其实就是全真教武功体系里同归剑法的绝招升级版，这套同归剑法取的便是同归于尽之意，剑招狠辣，凌厉无比，施展全真剑法里的同归剑法绝招时，和同归剑法本身绝招一样，也要永久性损失掉不少上限内力。
当然了，付出那么大的代价当然也是有回报的，想当初第一届华让。论剑团体赛时，已经是全真弃徒的太阳便是用同归剑法秒杀了几名全真教玩家，那是的同归剑法还仅仅只是初级版的，如今以全真剑法的绝招施展出来，其威力早已不可同日而语，同样也具备秒杀对手的强悍威力。
最后一项绝招双剑合璧就不多说了，此招单独也可以使用，但只是二流绝招，唯有配合玉女剑法才能将其威力发挥到极致，形成不弱于超级武功绝招威力的合击特技。
全真教其他的武功，还有玄门心法，乃是门派初级内功。轻功方面有金雁功、天山飞渡，方杰当初在郭府的时候，耶律齐就曾当面施展过金雁功，该身法施展时，身影时如鹰击长空、时如群雁飞舞，令人眼花撩乱，煞是好看，实际效果还能对身法和防御有一定的加成。
空手技能方面，掌法有重阳神掌和昊天掌法，这两门掌法可分别与全真教的终南指法和七星分天手互备，进而双手冉时施展，还有周伯通的空明拳，不过这门拳法已经说过，乃是公共技能，需要解谜才能习得，只是对全真教的玩家来说，其解谜过程要稍稍简单一些。
兵器技能方面只有剑法和鞭法，剑法不多说了，除了全真剑法和同归剑法外，就只有七星剑法，而鞭法，准确点说，应该是尘法，因为所使兵器并不是长鞭，而是拂尘，鞭法技能名为天罡尘法，威力一般，全真教弟子很少施展这门鞭法，甚至有的人学都没学，毕竟一个。大男人整天带着一拂尘到处溜达确实有点自毁形象。
除了这些技能外，全真教还有一项比较特殊的招架技能，名为金关玉锁，此技能既是主动技能又是被动技能，作为主动技能施展时，可施展其绝招玄门金锁，乃是玄奥莫测的道家秘技，辅以内劲打乱对方的内息和节奏，使对手短时间内无法进攻或是逃走，且自身的内力损耗极少，厉害非常。
而如果作为被动技能施展，则可以与其他攻击性武功互备，在遇到对手攻击时，可形成一定条件反射的招架动作，其招架性能虽比不上乾坤大挪移、斗转星移剑法或是太极拳、太极剑，但除了这几项招架性能极强的武功之外，各派武功体系里，就属金关玉锁的招架性能最强了，所以也算是全真教的一个优势。
全真教武功体系里，除了以上这些武功外，就是人人都知道的双手互搏术了。
不过，这项技能也需要解谜才能学习，方杰在找王重阳成为全真教客卿的时候曾打听过，双手互搏术虽然对悟性有极高的要求，”准确点说，是极低的要求，先天悟性不得超过旧点，但这项设定只是针对一般人而言，作为能学全天下武功的武学废材方杰，也是有资格习得双手互搏术的，所以，方杰大喜之余，心中也有了打算，决定等门派历练完成，开始专心做主线任务时，一定得把双手互搏术也给学了，那时，自己的攻击和防御力理论上将会提升一倍，天下再也难逢敌手了！，